Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gli1P47806 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli1P47806 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli1P47806 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gli1P47806 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli1P47806 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli1P47806 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli1P47806 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli1P47806 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli1P47806 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli1P47806 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli1P47806 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli1P47806 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli1P47806 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli1P47806 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli1P47806 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli1P47806 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli1P47806 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli1P47806 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli1P47806 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli1P47806 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli1P47806 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli1P47806 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli1P47806 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli1P47806 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli1P47806 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli1P47806 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli1P47806 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli1P47806 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli1P47806 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli1P47806 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli1P47806 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli1P47806 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Gli1P47806 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gli1P47806 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli1P47806 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli1P47806 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli1P47806 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli1P47806 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gli1P47806 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli1P47806 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gli1P47806 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gli1P47806 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gli1P47806 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gli1P47806 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gli1P47806 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gli1P47806 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gli1P47806 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gli1P47806 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gli1P47806 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gli1P47806 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gli1P47806 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gli1P47806 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli1P47806 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli1P47806 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli1P47806 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli1P47806 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli1P47806 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli1P47806 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli1P47806 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli1P47806 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli1P47806 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli1P47806 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli1P47806 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli1P47806 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli1P47806 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli1P47806 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli1P47806 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli1P47806 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli1P47806 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms