Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elk1P41969 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elk1P41969 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elk1P41969 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Elk1P41969 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Elk1P41969 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elk1P41969 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elk1P41969 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Elk1P41969 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Elk1P41969 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elk1P41969 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Elk1P41969 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Elk1P41969 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elk1P41969 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elk1P41969 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Elk1P41969 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Elk1P41969 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Elk1P41969 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Elk1P41969 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Elk1P41969 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Elk1P41969 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Elk1P41969 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Elk1P41969 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Elk1P41969 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Elk1P41969 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Elk1P41969 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elk1P41969 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Elk1P41969 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Elk1P41969 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Elk1P41969 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elk1P41969 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Elk1P41969 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elk1P41969 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elk1P41969 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elk1P41969 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Elk1P41969 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elk1P41969 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elk1P41969 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elk1P41969 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elk1P41969 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elk1P41969 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elk1P41969 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Elk1P41969 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Elk1P41969 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Elk1P41969 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Elk1P41969 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Elk1P41969 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Elk1P41969 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Elk1P41969 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Elk1P41969 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Elk1P41969 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Elk1P41969 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Elk1P41969 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Elk1P41969 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Elk1P41969 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Elk1P41969 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Elk1P41969 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Elk1P41969 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elk1P41969 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elk1P41969 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elk1P41969 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elk1P41969 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Elk1P41969 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Elk1P41969 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Elk1P41969 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Elk1P41969 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Elk1P41969 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Elk1P41969 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms