Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rfc1P35601 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rfc1P35601 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rfc1P35601 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rfc1P35601 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rfc1P35601 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rfc1P35601 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Rfc1P35601 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Rfc1P35601 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Rfc1P35601 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rfc1P35601 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rfc1P35601 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rfc1P35601 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rfc1P35601 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rfc1P35601 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Rfc1P35601 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rfc1P35601 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rfc1P35601 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Rfc1P35601 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Rfc1P35601 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rfc1P35601 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rfc1P35601 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rfc1P35601 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rfc1P35601 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Rfc1P35601 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rfc1P35601 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Rfc1P35601 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rfc1P35601 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rfc1P35601 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rfc1P35601 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rfc1P35601 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rfc1P35601 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rfc1P35601 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rfc1P35601 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rfc1P35601 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rfc1P35601 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rfc1P35601 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rfc1P35601 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rfc1P35601 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rfc1P35601 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rfc1P35601 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rfc1P35601 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rfc1P35601 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rfc1P35601 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rfc1P35601 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rfc1P35601 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Rfc1P35601 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rfc1P35601 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rfc1P35601 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Rfc1P35601 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rfc1P35601 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rfc1P35601 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Rfc1P35601 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rfc1P35601 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rfc1P35601 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rfc1P35601 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rfc1P35601 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rfc1P35601 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rfc1P35601 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rfc1P35601 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rfc1P35601 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rfc1P35601 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65,6 ms