Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oprk1P33534 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Oprk1P33534 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Oprk1P33534 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oprk1P33534 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oprk1P33534 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oprk1P33534 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oprk1P33534 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oprk1P33534 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oprk1P33534 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oprk1P33534 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oprk1P33534 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oprk1P33534 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oprk1P33534 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Oprk1P33534 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Oprk1P33534 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Oprk1P33534 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Oprk1P33534 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Oprk1P33534 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Oprk1P33534 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Oprk1P33534 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Oprk1P33534 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Oprk1P33534 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oprk1P33534 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Oprk1P33534 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Oprk1P33534 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Oprk1P33534 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Oprk1P33534 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Oprk1P33534 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Oprk1P33534 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprk1P33534 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Oprk1P33534 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oprk1P33534 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oprk1P33534 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oprk1P33534 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Oprk1P33534 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprk1P33534 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Oprk1P33534 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oprk1P33534 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oprk1P33534 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oprk1P33534 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Oprk1P33534 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms