Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msr1P30204 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msr1P30204 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msr1P30204 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msr1P30204 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msr1P30204 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msr1P30204 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msr1P30204 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msr1P30204 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Msr1P30204 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Msr1P30204 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msr1P30204 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msr1P30204 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msr1P30204 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msr1P30204 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msr1P30204 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msr1P30204 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msr1P30204 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msr1P30204 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Msr1P30204 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Msr1P30204 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msr1P30204 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msr1P30204 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msr1P30204 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msr1P30204 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msr1P30204 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msr1P30204 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msr1P30204 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msr1P30204 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msr1P30204 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Msr1P30204 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msr1P30204 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msr1P30204 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msr1P30204 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Msr1P30204 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msr1P30204 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msr1P30204 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msr1P30204 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msr1P30204 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msr1P30204 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msr1P30204 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Msr1P30204 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msr1P30204 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msr1P30204 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Msr1P30204 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msr1P30204 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msr1P30204 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msr1P30204 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msr1P30204 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msr1P30204 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msr1P30204 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msr1P30204 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msr1P30204 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msr1P30204 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msr1P30204 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msr1P30204 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msr1P30204 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms