Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gria1P23818 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gria1P23818 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gria1P23818 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gria1P23818 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gria1P23818 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gria1P23818 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gria1P23818 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gria1P23818 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gria1P23818 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gria1P23818 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gria1P23818 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gria1P23818 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gria1P23818 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gria1P23818 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gria1P23818 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gria1P23818 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gria1P23818 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gria1P23818 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gria1P23818 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gria1P23818 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gria1P23818 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gria1P23818 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gria1P23818 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gria1P23818 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gria1P23818 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gria1P23818 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gria1P23818 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gria1P23818 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gria1P23818 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gria1P23818 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gria1P23818 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gria1P23818 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gria1P23818 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gria1P23818 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gria1P23818 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gria1P23818 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria1P23818 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria1P23818 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gria1P23818 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gria1P23818 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria1P23818 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria1P23818 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria1P23818 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gria1P23818 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria1P23818 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria1P23818 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria1P23818 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gria1P23818 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria1P23818 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gria1P23818 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria1P23818 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria1P23818 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gria1P23818 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gria1P23818 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria1P23818 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria1P23818 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gria1P23818 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria1P23818 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gria1P23818 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gria1P23818 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria1P23818 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria1P23818 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria1P23818 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria1P23818 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria1P23818 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria1P23818 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms