Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rps6ka3P18654 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka3P18654 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka3P18654 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka3P18654 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka3P18654 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rps6ka3P18654 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka3P18654 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rps6ka3P18654 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rps6ka3P18654 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rps6ka3P18654 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rps6ka3P18654 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka3P18654 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka3P18654 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rps6ka3P18654 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka3P18654 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6ka3P18654 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka3P18654 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka3P18654 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6ka3P18654 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka3P18654 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka3P18654 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka3P18654 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka3P18654 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka3P18654 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka3P18654 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka3P18654 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka3P18654 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka3P18654 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka3P18654 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka3P18654 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka3P18654 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka3P18654 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka3P18654 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka3P18654 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka3P18654 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka3P18654 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka3P18654 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6ka3P18654 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps6ka3P18654 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka3P18654 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka3P18654 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka3P18654 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka3P18654 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6ka3P18654 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6ka3P18654 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka3P18654 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka3P18654 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka3P18654 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka3P18654 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka3P18654 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka3P18654 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka3P18654 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka3P18654 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka3P18654 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka3P18654 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6ka3P18654 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms