Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rps6ka3P18654 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rps6ka3P18654 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rps6ka3P18654 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rps6ka3P18654 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rps6ka3P18654 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rps6ka3P18654 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rps6ka3P18654 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rps6ka3P18654 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rps6ka3P18654 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rps6ka3P18654 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rps6ka3P18654 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rps6ka3P18654 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rps6ka3P18654 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rps6ka3P18654 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rps6ka3P18654 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rps6ka3P18654 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rps6ka3P18654 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rps6ka3P18654 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rps6ka3P18654 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Rps6ka3P18654 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rps6ka3P18654 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rps6ka3P18654 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rps6ka3P18654 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rps6ka3P18654 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rps6ka3P18654 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rps6ka3P18654 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rps6ka3P18654 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rps6ka3P18654 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rps6ka3P18654 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rps6ka3P18654 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rps6ka3P18654 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rps6ka3P18654 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rps6ka3P18654 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rps6ka3P18654 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rps6ka3P18654 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rps6ka3P18654 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rps6ka3P18654 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rps6ka3P18654 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rps6ka3P18654 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rps6ka3P18654 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rps6ka3P18654 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rps6ka3P18654 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rps6ka3P18654 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Rps6ka3P18654 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,89■■□□□ 1,57
Rps6ka3P18654 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rps6ka3P18654 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rps6ka3P18654 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Rps6ka3P18654 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rps6ka3P18654 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rps6ka3P18654 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rps6ka3P18654 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rps6ka3P18654 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rps6ka3P18654 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Rps6ka3P18654 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rps6ka3P18654 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rps6ka3P18654 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rps6ka3P18654 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms