Protein–RNA interactions for Protein: P17439

Gba, Glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GbaP17439 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GbaP17439 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GbaP17439 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GbaP17439 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GbaP17439 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GbaP17439 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GbaP17439 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GbaP17439 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GbaP17439 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GbaP17439 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GbaP17439 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GbaP17439 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GbaP17439 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GbaP17439 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GbaP17439 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GbaP17439 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GbaP17439 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GbaP17439 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GbaP17439 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GbaP17439 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GbaP17439 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GbaP17439 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GbaP17439 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GbaP17439 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GbaP17439 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GbaP17439 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GbaP17439 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GbaP17439 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GbaP17439 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GbaP17439 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GbaP17439 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GbaP17439 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GbaP17439 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GbaP17439 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GbaP17439 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GbaP17439 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GbaP17439 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GbaP17439 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GbaP17439 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GbaP17439 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GbaP17439 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GbaP17439 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GbaP17439 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GbaP17439 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GbaP17439 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GbaP17439 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GbaP17439 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GbaP17439 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GbaP17439 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GbaP17439 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GbaP17439 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GbaP17439 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GbaP17439 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GbaP17439 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GbaP17439 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GbaP17439 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GbaP17439 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GbaP17439 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GbaP17439 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GbaP17439 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GbaP17439 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GbaP17439 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GbaP17439 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GbaP17439 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GbaP17439 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GbaP17439 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GbaP17439 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GbaP17439 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GbaP17439 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GbaP17439 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GbaP17439 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GbaP17439 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GbaP17439 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GbaP17439 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GbaP17439 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GbaP17439 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GbaP17439 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GbaP17439 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GbaP17439 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GbaP17439 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GbaP17439 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GbaP17439 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GbaP17439 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GbaP17439 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GbaP17439 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GbaP17439 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GbaP17439 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GbaP17439 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GbaP17439 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GbaP17439 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GbaP17439 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GbaP17439 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GbaP17439 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GbaP17439 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GbaP17439 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GbaP17439 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GbaP17439 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GbaP17439 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GbaP17439 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GbaP17439 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms