Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr4a1P12813 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nr4a1P12813 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a1P12813 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a1P12813 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a1P12813 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr4a1P12813 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr4a1P12813 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr4a1P12813 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr4a1P12813 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr4a1P12813 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr4a1P12813 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr4a1P12813 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr4a1P12813 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr4a1P12813 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr4a1P12813 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr4a1P12813 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr4a1P12813 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr4a1P12813 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr4a1P12813 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr4a1P12813 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr4a1P12813 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr4a1P12813 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr4a1P12813 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr4a1P12813 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr4a1P12813 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr4a1P12813 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr4a1P12813 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr4a1P12813 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr4a1P12813 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr4a1P12813 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr4a1P12813 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr4a1P12813 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr4a1P12813 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr4a1P12813 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr4a1P12813 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a1P12813 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr4a1P12813 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr4a1P12813 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr4a1P12813 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr4a1P12813 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr4a1P12813 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a1P12813 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr4a1P12813 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr4a1P12813 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a1P12813 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a1P12813 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr4a1P12813 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr4a1P12813 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr4a1P12813 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr4a1P12813 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr4a1P12813 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr4a1P12813 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr4a1P12813 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr4a1P12813 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr4a1P12813 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr4a1P12813 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr4a1P12813 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr4a1P12813 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr4a1P12813 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms