Protein–RNA interactions for Protein: P0C192

Lrrc4b, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4bP0C192 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Lrrc4bP0C192 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Lrrc4bP0C192 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Lrrc4bP0C192 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Lrrc4bP0C192 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Lrrc4bP0C192 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Lrrc4bP0C192 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Lrrc4bP0C192 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Lrrc4bP0C192 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Lrrc4bP0C192 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Lrrc4bP0C192 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Lrrc4bP0C192 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Lrrc4bP0C192 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Lrrc4bP0C192 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Lrrc4bP0C192 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Lrrc4bP0C192 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Lrrc4bP0C192 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lrrc4bP0C192 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lrrc4bP0C192 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Lrrc4bP0C192 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Lrrc4bP0C192 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Lrrc4bP0C192 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Lrrc4bP0C192 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Lrrc4bP0C192 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Lrrc4bP0C192 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Lrrc4bP0C192 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Lrrc4bP0C192 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Lrrc4bP0C192 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Lrrc4bP0C192 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Lrrc4bP0C192 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Lrrc4bP0C192 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Lrrc4bP0C192 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Lrrc4bP0C192 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Lrrc4bP0C192 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Lrrc4bP0C192 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Lrrc4bP0C192 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Lrrc4bP0C192 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Lrrc4bP0C192 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Lrrc4bP0C192 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Lrrc4bP0C192 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Lrrc4bP0C192 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lrrc4bP0C192 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lrrc4bP0C192 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Lrrc4bP0C192 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Lrrc4bP0C192 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Lrrc4bP0C192 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Lrrc4bP0C192 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Lrrc4bP0C192 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Lrrc4bP0C192 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lrrc4bP0C192 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lrrc4bP0C192 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Lrrc4bP0C192 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Lrrc4bP0C192 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lrrc4bP0C192 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lrrc4bP0C192 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Lrrc4bP0C192 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Lrrc4bP0C192 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Lrrc4bP0C192 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lrrc4bP0C192 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lrrc4bP0C192 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Lrrc4bP0C192 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lrrc4bP0C192 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Lrrc4bP0C192 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lrrc4bP0C192 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lrrc4bP0C192 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Lrrc4bP0C192 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Lrrc4bP0C192 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Lrrc4bP0C192 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lrrc4bP0C192 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lrrc4bP0C192 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Lrrc4bP0C192 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Lrrc4bP0C192 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms