Protein–RNA interactions for Protein: P08003

Pdia4, Protein disulfide-isomerase A4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdia4P08003 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pdia4P08003 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pdia4P08003 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pdia4P08003 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pdia4P08003 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pdia4P08003 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdia4P08003 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdia4P08003 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pdia4P08003 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pdia4P08003 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pdia4P08003 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pdia4P08003 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pdia4P08003 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pdia4P08003 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pdia4P08003 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pdia4P08003 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pdia4P08003 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pdia4P08003 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdia4P08003 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdia4P08003 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdia4P08003 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdia4P08003 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdia4P08003 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdia4P08003 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdia4P08003 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdia4P08003 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pdia4P08003 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pdia4P08003 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdia4P08003 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pdia4P08003 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdia4P08003 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdia4P08003 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdia4P08003 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdia4P08003 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdia4P08003 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pdia4P08003 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdia4P08003 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdia4P08003 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdia4P08003 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdia4P08003 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdia4P08003 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdia4P08003 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdia4P08003 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdia4P08003 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdia4P08003 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdia4P08003 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdia4P08003 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdia4P08003 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdia4P08003 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdia4P08003 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdia4P08003 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdia4P08003 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdia4P08003 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdia4P08003 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdia4P08003 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdia4P08003 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdia4P08003 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdia4P08003 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdia4P08003 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdia4P08003 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdia4P08003 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdia4P08003 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdia4P08003 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdia4P08003 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdia4P08003 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdia4P08003 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdia4P08003 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdia4P08003 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdia4P08003 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdia4P08003 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms