Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3pxd2aO89032 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3pxd2aO89032 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3pxd2aO89032 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3pxd2aO89032 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3pxd2aO89032 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3pxd2aO89032 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3pxd2aO89032 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3pxd2aO89032 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3pxd2aO89032 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3pxd2aO89032 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3pxd2aO89032 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3pxd2aO89032 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3pxd2aO89032 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3pxd2aO89032 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3pxd2aO89032 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3pxd2aO89032 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3pxd2aO89032 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3pxd2aO89032 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3pxd2aO89032 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3pxd2aO89032 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3pxd2aO89032 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3pxd2aO89032 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3pxd2aO89032 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3pxd2aO89032 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3pxd2aO89032 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3pxd2aO89032 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3pxd2aO89032 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3pxd2aO89032 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3pxd2aO89032 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3pxd2aO89032 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3pxd2aO89032 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3pxd2aO89032 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3pxd2aO89032 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3pxd2aO89032 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3pxd2aO89032 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3pxd2aO89032 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3pxd2aO89032 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3pxd2aO89032 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3pxd2aO89032 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3pxd2aO89032 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3pxd2aO89032 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3pxd2aO89032 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3pxd2aO89032 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3pxd2aO89032 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3pxd2aO89032 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3pxd2aO89032 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3pxd2aO89032 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3pxd2aO89032 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3pxd2aO89032 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2aO89032 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3pxd2aO89032 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3pxd2aO89032 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3pxd2aO89032 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3pxd2aO89032 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3pxd2aO89032 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3pxd2aO89032 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3pxd2aO89032 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3pxd2aO89032 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3pxd2aO89032 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2aO89032 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3pxd2aO89032 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3pxd2aO89032 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3pxd2aO89032 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3pxd2aO89032 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms