Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srpk1O70551 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Srpk1O70551 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srpk1O70551 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk1O70551 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk1O70551 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Srpk1O70551 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk1O70551 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk1O70551 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk1O70551 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk1O70551 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk1O70551 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srpk1O70551 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srpk1O70551 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Srpk1O70551 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srpk1O70551 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Srpk1O70551 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srpk1O70551 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srpk1O70551 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srpk1O70551 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srpk1O70551 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srpk1O70551 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk1O70551 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk1O70551 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk1O70551 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk1O70551 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srpk1O70551 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk1O70551 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srpk1O70551 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srpk1O70551 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srpk1O70551 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srpk1O70551 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srpk1O70551 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Srpk1O70551 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srpk1O70551 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srpk1O70551 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srpk1O70551 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srpk1O70551 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srpk1O70551 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Srpk1O70551 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srpk1O70551 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srpk1O70551 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srpk1O70551 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srpk1O70551 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srpk1O70551 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srpk1O70551 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srpk1O70551 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Srpk1O70551 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Srpk1O70551 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srpk1O70551 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srpk1O70551 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srpk1O70551 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srpk1O70551 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Srpk1O70551 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Srpk1O70551 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk1O70551 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Srpk1O70551 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Srpk1O70551 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk1O70551 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk1O70551 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk1O70551 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk1O70551 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk1O70551 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srpk1O70551 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Srpk1O70551 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Srpk1O70551 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srpk1O70551 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srpk1O70551 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srpk1O70551 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srpk1O70551 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Srpk1O70551 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Srpk1O70551 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Srpk1O70551 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srpk1O70551 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 864.4 ms