Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lnx1O70263 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lnx1O70263 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lnx1O70263 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lnx1O70263 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lnx1O70263 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lnx1O70263 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Lnx1O70263 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lnx1O70263 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lnx1O70263 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lnx1O70263 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lnx1O70263 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lnx1O70263 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lnx1O70263 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lnx1O70263 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lnx1O70263 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lnx1O70263 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lnx1O70263 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lnx1O70263 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lnx1O70263 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lnx1O70263 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lnx1O70263 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lnx1O70263 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Lnx1O70263 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lnx1O70263 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lnx1O70263 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lnx1O70263 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lnx1O70263 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lnx1O70263 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lnx1O70263 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lnx1O70263 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Lnx1O70263 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lnx1O70263 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lnx1O70263 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lnx1O70263 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lnx1O70263 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lnx1O70263 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lnx1O70263 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lnx1O70263 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lnx1O70263 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lnx1O70263 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lnx1O70263 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lnx1O70263 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lnx1O70263 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lnx1O70263 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Lnx1O70263 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lnx1O70263 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lnx1O70263 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lnx1O70263 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Lnx1O70263 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lnx1O70263 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lnx1O70263 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lnx1O70263 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lnx1O70263 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lnx1O70263 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lnx1O70263 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lnx1O70263 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lnx1O70263 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lnx1O70263 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Lnx1O70263 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lnx1O70263 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lnx1O70263 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lnx1O70263 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lnx1O70263 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lnx1O70263 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lnx1O70263 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lnx1O70263 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lnx1O70263 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lnx1O70263 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lnx1O70263 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lnx1O70263 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lnx1O70263 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lnx1O70263 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Lnx1O70263 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lnx1O70263 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lnx1O70263 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lnx1O70263 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
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