Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Limk2O54785 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Limk2O54785 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Limk2O54785 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Limk2O54785 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Limk2O54785 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Limk2O54785 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Limk2O54785 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Limk2O54785 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Limk2O54785 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Limk2O54785 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Limk2O54785 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Limk2O54785 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Limk2O54785 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Limk2O54785 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Limk2O54785 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Limk2O54785 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Limk2O54785 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Limk2O54785 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Limk2O54785 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Limk2O54785 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Limk2O54785 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Limk2O54785 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Limk2O54785 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Limk2O54785 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Limk2O54785 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Limk2O54785 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Limk2O54785 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Limk2O54785 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Limk2O54785 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Limk2O54785 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Limk2O54785 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Limk2O54785 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Limk2O54785 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Limk2O54785 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Limk2O54785 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Limk2O54785 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Limk2O54785 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Limk2O54785 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Limk2O54785 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Limk2O54785 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Limk2O54785 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Limk2O54785 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Limk2O54785 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Limk2O54785 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Limk2O54785 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Limk2O54785 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Limk2O54785 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Limk2O54785 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Limk2O54785 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Limk2O54785 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Limk2O54785 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Limk2O54785 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Limk2O54785 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Limk2O54785 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Limk2O54785 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Limk2O54785 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Limk2O54785 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Limk2O54785 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Limk2O54785 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Limk2O54785 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Limk2O54785 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Limk2O54785 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Limk2O54785 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Limk2O54785 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Limk2O54785 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Limk2O54785 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Limk2O54785 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Limk2O54785 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Limk2O54785 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Limk2O54785 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Limk2O54785 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Limk2O54785 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Limk2O54785 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Limk2O54785 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Limk2O54785 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Limk2O54785 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Limk2O54785 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Limk2O54785 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms