Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Klf12O35738 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Klf12O35738 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Klf12O35738 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Klf12O35738 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Klf12O35738 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Klf12O35738 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Klf12O35738 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Klf12O35738 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Klf12O35738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Klf12O35738 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Klf12O35738 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Klf12O35738 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Klf12O35738 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Klf12O35738 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Klf12O35738 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Klf12O35738 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Klf12O35738 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Klf12O35738 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Klf12O35738 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Klf12O35738 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Klf12O35738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Klf12O35738 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Klf12O35738 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Klf12O35738 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Klf12O35738 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Klf12O35738 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Klf12O35738 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Klf12O35738 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
Klf12O35738 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
Klf12O35738 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Klf12O35738 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Klf12O35738 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Klf12O35738 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Klf12O35738 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Klf12O35738 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Klf12O35738 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Klf12O35738 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,33■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Klf12O35738 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Klf12O35738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Klf12O35738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Klf12O35738 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,05■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Klf12O35738 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Klf12O35738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Klf12O35738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,02■□□□□ 0,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms