Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lhx8O35652 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lhx8O35652 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lhx8O35652 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lhx8O35652 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lhx8O35652 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lhx8O35652 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lhx8O35652 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lhx8O35652 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lhx8O35652 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lhx8O35652 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lhx8O35652 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lhx8O35652 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lhx8O35652 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lhx8O35652 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lhx8O35652 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lhx8O35652 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lhx8O35652 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lhx8O35652 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lhx8O35652 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lhx8O35652 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lhx8O35652 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lhx8O35652 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lhx8O35652 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lhx8O35652 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lhx8O35652 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lhx8O35652 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lhx8O35652 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lhx8O35652 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lhx8O35652 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lhx8O35652 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lhx8O35652 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lhx8O35652 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lhx8O35652 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lhx8O35652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lhx8O35652 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lhx8O35652 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lhx8O35652 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhx8O35652 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lhx8O35652 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lhx8O35652 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lhx8O35652 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lhx8O35652 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lhx8O35652 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lhx8O35652 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lhx8O35652 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lhx8O35652 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lhx8O35652 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lhx8O35652 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lhx8O35652 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lhx8O35652 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lhx8O35652 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lhx8O35652 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhx8O35652 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhx8O35652 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lhx8O35652 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lhx8O35652 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lhx8O35652 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lhx8O35652 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lhx8O35652 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lhx8O35652 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lhx8O35652 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lhx8O35652 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lhx8O35652 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhx8O35652 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms