Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3239L7N2D9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3239L7N2D9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3239L7N2D9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3239L7N2D9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3239L7N2D9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3239L7N2D9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3239L7N2D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3239L7N2D9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3239L7N2D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3239L7N2D9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3239L7N2D9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3239L7N2D9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3239L7N2D9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3239L7N2D9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3239L7N2D9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3239L7N2D9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3239L7N2D9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3239L7N2D9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3239L7N2D9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3239L7N2D9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3239L7N2D9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3239L7N2D9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3239L7N2D9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3239L7N2D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3239L7N2D9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3239L7N2D9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3239L7N2D9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3239L7N2D9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3239L7N2D9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3239L7N2D9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3239L7N2D9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3239L7N2D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3239L7N2D9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3239L7N2D9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3239L7N2D9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3239L7N2D9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3239L7N2D9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3239L7N2D9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3239L7N2D9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3239L7N2D9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3239L7N2D9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3239L7N2D9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3239L7N2D9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3239L7N2D9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3239L7N2D9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3239L7N2D9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3239L7N2D9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3239L7N2D9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3239L7N2D9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3239L7N2D9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3239L7N2D9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3239L7N2D9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3239L7N2D9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3239L7N2D9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3239L7N2D9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3239L7N2D9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms