Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp955bL7N232 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp955bL7N232 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp955bL7N232 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp955bL7N232 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp955bL7N232 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp955bL7N232 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp955bL7N232 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp955bL7N232 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp955bL7N232 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp955bL7N232 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp955bL7N232 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp955bL7N232 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp955bL7N232 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp955bL7N232 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp955bL7N232 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp955bL7N232 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp955bL7N232 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp955bL7N232 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp955bL7N232 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp955bL7N232 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp955bL7N232 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp955bL7N232 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp955bL7N232 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp955bL7N232 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp955bL7N232 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp955bL7N232 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp955bL7N232 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp955bL7N232 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp955bL7N232 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp955bL7N232 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp955bL7N232 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp955bL7N232 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp955bL7N232 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp955bL7N232 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp955bL7N232 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp955bL7N232 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp955bL7N232 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp955bL7N232 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp955bL7N232 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp955bL7N232 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp955bL7N232 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp955bL7N232 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp955bL7N232 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp955bL7N232 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms