Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
7530416G11RikJ3QJX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
7530416G11RikJ3QJX6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
7530416G11RikJ3QJX6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
7530416G11RikJ3QJX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
7530416G11RikJ3QJX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
7530416G11RikJ3QJX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
7530416G11RikJ3QJX6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
7530416G11RikJ3QJX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms