Protein–RNA interactions for Protein: I6L9G2

Gm42641, 6620401K05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42641I6L9G2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gm42641I6L9G2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gm42641I6L9G2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gm42641I6L9G2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gm42641I6L9G2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gm42641I6L9G2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gm42641I6L9G2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Gm42641I6L9G2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gm42641I6L9G2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Gm42641I6L9G2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Gm42641I6L9G2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gm42641I6L9G2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gm42641I6L9G2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gm42641I6L9G2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gm42641I6L9G2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Gm42641I6L9G2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gm42641I6L9G2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm42641I6L9G2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Gm42641I6L9G2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gm42641I6L9G2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gm42641I6L9G2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gm42641I6L9G2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gm42641I6L9G2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gm42641I6L9G2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gm42641I6L9G2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Gm42641I6L9G2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Gm42641I6L9G2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gm42641I6L9G2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Gm42641I6L9G2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Gm42641I6L9G2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gm42641I6L9G2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gm42641I6L9G2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gm42641I6L9G2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gm42641I6L9G2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
Gm42641I6L9G2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Gm42641I6L9G2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gm42641I6L9G2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gm42641I6L9G2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Gm42641I6L9G2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Gm42641I6L9G2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Gm42641I6L9G2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Gm42641I6L9G2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Gm42641I6L9G2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Gm42641I6L9G2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Gm42641I6L9G2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Gm42641I6L9G2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Gm42641I6L9G2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Gm42641I6L9G2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Gm42641I6L9G2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Gm42641I6L9G2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Gm42641I6L9G2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Gm42641I6L9G2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Gm42641I6L9G2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Gm42641I6L9G2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Gm42641I6L9G2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Gm42641I6L9G2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Gm42641I6L9G2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Gm42641I6L9G2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Gm42641I6L9G2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Gm42641I6L9G2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Gm42641I6L9G2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Gm42641I6L9G2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gm42641I6L9G2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms