Protein–RNA interactions for Protein: G3X9D6

Apon, Apolipoprotein N, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AponG3X9D6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AponG3X9D6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AponG3X9D6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AponG3X9D6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AponG3X9D6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AponG3X9D6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AponG3X9D6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AponG3X9D6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AponG3X9D6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AponG3X9D6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AponG3X9D6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AponG3X9D6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AponG3X9D6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AponG3X9D6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
AponG3X9D6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AponG3X9D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AponG3X9D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AponG3X9D6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AponG3X9D6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AponG3X9D6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AponG3X9D6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms