Protein–RNA interactions for Protein: F6ZL36

Gm17606, Predicted gene, 17606, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17606F6ZL36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17606F6ZL36 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17606F6ZL36 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17606F6ZL36 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm17606F6ZL36 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17606F6ZL36 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17606F6ZL36 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm17606F6ZL36 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm17606F6ZL36 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm17606F6ZL36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm17606F6ZL36 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm17606F6ZL36 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm17606F6ZL36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm17606F6ZL36 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17606F6ZL36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm17606F6ZL36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm17606F6ZL36 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm17606F6ZL36 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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