Protein–RNA interactions for Protein: F6YTZ4

Gm6576, Predicted gene 6576, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6576F6YTZ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm6576F6YTZ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6576F6YTZ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6576F6YTZ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6576F6YTZ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6576F6YTZ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm6576F6YTZ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6576F6YTZ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6576F6YTZ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6576F6YTZ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6576F6YTZ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6576F6YTZ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6576F6YTZ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6576F6YTZ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm6576F6YTZ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6576F6YTZ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6576F6YTZ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6576F6YTZ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6576F6YTZ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm6576F6YTZ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6576F6YTZ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6576F6YTZ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm6576F6YTZ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm6576F6YTZ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6576F6YTZ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6576F6YTZ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm6576F6YTZ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6576F6YTZ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm6576F6YTZ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6576F6YTZ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6576F6YTZ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm6576F6YTZ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm6576F6YTZ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm6576F6YTZ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm6576F6YTZ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm6576F6YTZ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm6576F6YTZ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm6576F6YTZ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6576F6YTZ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6576F6YTZ4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6576F6YTZ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6576F6YTZ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6576F6YTZ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm6576F6YTZ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm6576F6YTZ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm6576F6YTZ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm6576F6YTZ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm6576F6YTZ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm6576F6YTZ4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm6576F6YTZ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm6576F6YTZ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm6576F6YTZ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm6576F6YTZ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm6576F6YTZ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm6576F6YTZ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm6576F6YTZ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm6576F6YTZ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm6576F6YTZ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6576F6YTZ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm6576F6YTZ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6576F6YTZ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6576F6YTZ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6576F6YTZ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6576F6YTZ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6576F6YTZ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms