Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa35E9QLQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa35E9QLQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa35E9QLQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa35E9QLQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa35E9QLQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa35E9QLQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa35E9QLQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa35E9QLQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Defa35E9QLQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa35E9QLQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa35E9QLQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa35E9QLQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Defa35E9QLQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa35E9QLQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa35E9QLQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa35E9QLQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Defa35E9QLQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa35E9QLQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa35E9QLQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Defa35E9QLQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa35E9QLQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa35E9QLQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa35E9QLQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa35E9QLQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa35E9QLQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa35E9QLQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa35E9QLQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa35E9QLQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa35E9QLQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa35E9QLQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa35E9QLQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms