Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ptar1E9QAB6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ptar1E9QAB6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ptar1E9QAB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptar1E9QAB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ptar1E9QAB6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptar1E9QAB6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptar1E9QAB6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptar1E9QAB6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptar1E9QAB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptar1E9QAB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptar1E9QAB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ptar1E9QAB6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptar1E9QAB6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptar1E9QAB6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptar1E9QAB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptar1E9QAB6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptar1E9QAB6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptar1E9QAB6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptar1E9QAB6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptar1E9QAB6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptar1E9QAB6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ptar1E9QAB6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ptar1E9QAB6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptar1E9QAB6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptar1E9QAB6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptar1E9QAB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptar1E9QAB6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptar1E9QAB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptar1E9QAB6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptar1E9QAB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptar1E9QAB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptar1E9QAB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptar1E9QAB6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptar1E9QAB6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptar1E9QAB6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptar1E9QAB6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptar1E9QAB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptar1E9QAB6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptar1E9QAB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptar1E9QAB6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptar1E9QAB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptar1E9QAB6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptar1E9QAB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptar1E9QAB6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptar1E9QAB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptar1E9QAB6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptar1E9QAB6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptar1E9QAB6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptar1E9QAB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptar1E9QAB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptar1E9QAB6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptar1E9QAB6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptar1E9QAB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms