Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim20D3Z7Q2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim20D3Z7Q2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim20D3Z7Q2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim20D3Z7Q2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim20D3Z7Q2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim20D3Z7Q2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim20D3Z7Q2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim20D3Z7Q2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim20D3Z7Q2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim20D3Z7Q2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim20D3Z7Q2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim20D3Z7Q2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim20D3Z7Q2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim20D3Z7Q2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim20D3Z7Q2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim20D3Z7Q2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim20D3Z7Q2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim20D3Z7Q2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim20D3Z7Q2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim20D3Z7Q2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim20D3Z7Q2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim20D3Z7Q2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms