Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r180B9EK86 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r180B9EK86 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r180B9EK86 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r180B9EK86 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r180B9EK86 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r180B9EK86 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r180B9EK86 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r180B9EK86 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r180B9EK86 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r180B9EK86 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r180B9EK86 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r180B9EK86 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r180B9EK86 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r180B9EK86 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r180B9EK86 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r180B9EK86 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r180B9EK86 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r180B9EK86 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r180B9EK86 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r180B9EK86 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r180B9EK86 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r180B9EK86 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r180B9EK86 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r180B9EK86 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r180B9EK86 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r180B9EK86 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r180B9EK86 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r180B9EK86 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r180B9EK86 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r180B9EK86 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r180B9EK86 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r180B9EK86 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r180B9EK86 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r180B9EK86 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r180B9EK86 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r180B9EK86 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r180B9EK86 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r180B9EK86 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r180B9EK86 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r180B9EK86 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r180B9EK86 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r180B9EK86 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r180B9EK86 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r180B9EK86 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r180B9EK86 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r180B9EK86 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms