Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud4B2RRE7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud4B2RRE7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otud4B2RRE7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Otud4B2RRE7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Otud4B2RRE7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Otud4B2RRE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otud4B2RRE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud4B2RRE7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud4B2RRE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud4B2RRE7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Otud4B2RRE7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud4B2RRE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud4B2RRE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud4B2RRE7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otud4B2RRE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud4B2RRE7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud4B2RRE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otud4B2RRE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud4B2RRE7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Otud4B2RRE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otud4B2RRE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otud4B2RRE7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otud4B2RRE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otud4B2RRE7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otud4B2RRE7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otud4B2RRE7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otud4B2RRE7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud4B2RRE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud4B2RRE7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Otud4B2RRE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otud4B2RRE7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Otud4B2RRE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otud4B2RRE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otud4B2RRE7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud4B2RRE7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud4B2RRE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud4B2RRE7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otud4B2RRE7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Otud4B2RRE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud4B2RRE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud4B2RRE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otud4B2RRE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud4B2RRE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud4B2RRE7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud4B2RRE7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud4B2RRE7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otud4B2RRE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud4B2RRE7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Otud4B2RRE7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otud4B2RRE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud4B2RRE7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud4B2RRE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otud4B2RRE7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud4B2RRE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud4B2RRE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud4B2RRE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud4B2RRE7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud4B2RRE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud4B2RRE7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud4B2RRE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud4B2RRE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud4B2RRE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otud4B2RRE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud4B2RRE7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud4B2RRE7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms