Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r5B2RQT2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r5B2RQT2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r5B2RQT2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r5B2RQT2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r5B2RQT2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r5B2RQT2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r5B2RQT2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r5B2RQT2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r5B2RQT2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r5B2RQT2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r5B2RQT2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r5B2RQT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r5B2RQT2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r5B2RQT2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r5B2RQT2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r5B2RQT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r5B2RQT2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r5B2RQT2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r5B2RQT2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r5B2RQT2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r5B2RQT2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r5B2RQT2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r5B2RQT2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r5B2RQT2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r5B2RQT2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r5B2RQT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r5B2RQT2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r5B2RQT2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r5B2RQT2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r5B2RQT2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r5B2RQT2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r5B2RQT2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r5B2RQT2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r5B2RQT2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r5B2RQT2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r5B2RQT2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r5B2RQT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r5B2RQT2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r5B2RQT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r5B2RQT2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r5B2RQT2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r5B2RQT2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r5B2RQT2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r5B2RQT2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r5B2RQT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r5B2RQT2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r5B2RQT2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r5B2RQT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r5B2RQT2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r5B2RQT2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r5B2RQT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r5B2RQT2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r5B2RQT2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r5B2RQT2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r5B2RQT2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r5B2RQT2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r5B2RQT2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r5B2RQT2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r5B2RQT2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r5B2RQT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r5B2RQT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 637.8 ms