Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem238A9JSM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem238A9JSM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem238A9JSM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem238A9JSM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem238A9JSM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem238A9JSM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem238A9JSM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem238A9JSM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem238A9JSM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem238A9JSM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem238A9JSM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem238A9JSM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem238A9JSM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem238A9JSM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem238A9JSM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem238A9JSM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem238A9JSM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem238A9JSM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem238A9JSM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem238A9JSM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem238A9JSM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem238A9JSM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem238A9JSM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms