Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Samt1A2BED8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Samt1A2BED8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Samt1A2BED8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Samt1A2BED8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Samt1A2BED8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Samt1A2BED8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Samt1A2BED8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Samt1A2BED8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Samt1A2BED8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Samt1A2BED8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Samt1A2BED8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Samt1A2BED8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Samt1A2BED8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Samt1A2BED8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Samt1A2BED8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
Samt1A2BED8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Samt1A2BED8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Samt1A2BED8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Samt1A2BED8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Samt1A2BED8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Samt1A2BED8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Samt1A2BED8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Samt1A2BED8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Samt1A2BED8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Samt1A2BED8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Samt1A2BED8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Samt1A2BED8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Samt1A2BED8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Samt1A2BED8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Samt1A2BED8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Samt1A2BED8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Samt1A2BED8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Samt1A2BED8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Samt1A2BED8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Samt1A2BED8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Samt1A2BED8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Samt1A2BED8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Samt1A2BED8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Samt1A2BED8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Samt1A2BED8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Samt1A2BED8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Samt1A2BED8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Samt1A2BED8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Samt1A2BED8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Samt1A2BED8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Samt1A2BED8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63,5 ms