Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprfA2A8L5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprfA2A8L5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprfA2A8L5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprfA2A8L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprfA2A8L5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprfA2A8L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprfA2A8L5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprfA2A8L5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprfA2A8L5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprfA2A8L5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprfA2A8L5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprfA2A8L5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprfA2A8L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprfA2A8L5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprfA2A8L5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprfA2A8L5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprfA2A8L5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprfA2A8L5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprfA2A8L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprfA2A8L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprfA2A8L5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprfA2A8L5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprfA2A8L5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprfA2A8L5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprfA2A8L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprfA2A8L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprfA2A8L5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprfA2A8L5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprfA2A8L5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprfA2A8L5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprfA2A8L5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprfA2A8L5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprfA2A8L5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprfA2A8L5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprfA2A8L5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprfA2A8L5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprfA2A8L5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprfA2A8L5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprfA2A8L5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprfA2A8L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprfA2A8L5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprfA2A8L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprfA2A8L5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprfA2A8L5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprfA2A8L5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprfA2A8L5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprfA2A8L5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprfA2A8L5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprfA2A8L5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprfA2A8L5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprfA2A8L5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprfA2A8L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprfA2A8L5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprfA2A8L5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprfA2A8L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprfA2A8L5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprfA2A8L5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprfA2A8L5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprfA2A8L5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms