Protein–RNA interactions for Protein: A0PJN4

Ube2ql1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2Q-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2ql1A0PJN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2ql1A0PJN4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2ql1A0PJN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2ql1A0PJN4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2ql1A0PJN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2ql1A0PJN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2ql1A0PJN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ube2ql1A0PJN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2ql1A0PJN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2ql1A0PJN4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2ql1A0PJN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2ql1A0PJN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2ql1A0PJN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2ql1A0PJN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2ql1A0PJN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2ql1A0PJN4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2ql1A0PJN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2ql1A0PJN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2ql1A0PJN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2ql1A0PJN4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2ql1A0PJN4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2ql1A0PJN4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2ql1A0PJN4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2ql1A0PJN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2ql1A0PJN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2ql1A0PJN4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube2ql1A0PJN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2ql1A0PJN4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2ql1A0PJN4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2ql1A0PJN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2ql1A0PJN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2ql1A0PJN4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2ql1A0PJN4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2ql1A0PJN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2ql1A0PJN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2ql1A0PJN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2ql1A0PJN4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2ql1A0PJN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2ql1A0PJN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2ql1A0PJN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2ql1A0PJN4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2ql1A0PJN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2ql1A0PJN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2ql1A0PJN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2ql1A0PJN4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2ql1A0PJN4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2ql1A0PJN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2ql1A0PJN4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2ql1A0PJN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2ql1A0PJN4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2ql1A0PJN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2ql1A0PJN4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2ql1A0PJN4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms