Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1700017N19RikA0A087WPJ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
1700017N19RikA0A087WPJ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
1700017N19RikA0A087WPJ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
1700017N19RikA0A087WPJ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1700017N19RikA0A087WPJ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
1700017N19RikA0A087WPJ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
1700017N19RikA0A087WPJ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700017N19RikA0A087WPJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700017N19RikA0A087WPJ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700017N19RikA0A087WPJ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
1700017N19RikA0A087WPJ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.2 ms