Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms