Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms