Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col4a3Q9QZS0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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