Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trpc3Q9QZC1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trpc3Q9QZC1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trpc3Q9QZC1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms