Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms