Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3b2Q9JME5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms