Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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