Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tspan13Q9D8C2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tspan13Q9D8C2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms