Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd1lQ9CXF7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd1lQ9CXF7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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