Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms