Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chmp3Q9CQ10 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp3Q9CQ10 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms