Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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