Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlgn1Q99K10 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms