Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms