Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfdQ925I7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.6 ms